Be atomo valentinio elektroninio apvalkalo struktūra yra 2s2, jo atominis spindulys yra 89 pm, Be2+ joninis spindulys yra 31 pm, o Be elektronegatyvumas yra 1,57. Dėl ypač mažo berilio atominio spindulio ir joninio spindulio bei santykinai didelio elektronegatyvumo berilio polinkis sudaryti kovalentinius ryšius yra reikšmingesnis, skirtingai nuo kitų tos pačios grupės elementų, kurie daugiausia sudaro joninius junginius. Todėl berilis dažnai pasižymi neįprastomis savybėmis, kurios skiriasi nuo kitų tos pačios šeimos elementų.
(1) Berilis lengvai sudaro tankią apsauginę plėvelę ant paviršiaus ir nesąveikauja su vandeniu, o kiti tos pačios šeimos metalai magnis, kalcis, stroncis ir baris lengvai reaguoja su vandeniu.
(2) Berilio hidroksidas yra amfoterinis, o kitų tos pačios šeimos elementų hidroksidai yra vidutinio stiprumo šarminiai arba stipriai šarminiai.
(3) Berilio druskos stipriai hidrolizuojamos ir susidaro tetraedriniai jonai [Be(H2O)4]2+, o Be-O ryšys yra labai stiprus, todėl susilpnėja OH ryšys, todėl hidratuoti berilio jonai turi tendenciją prarasti protonus:
Taigi berilio druskos yra rūgštinės gryname vandenyje. Kitų tos pačios šeimos elementų druskos (išskyrus magnį) hidrolizės nevyksta.